Devant tant de gentillesse et d’amour, il fallait bien un personnage exécrable, et Ichiro Yamada remplit parfaitement le rôle du méchant ! Le professeur Yamada dirige le service de neurologie d’une des principales universités en médecine du Japon. Il est également un neurochirurgien extrêmement connu, et sa réputation lui vaut le surnom de « Main de Dieu ». Actuellement, ses travaux de recherches se focalisent sur le syndrome de dégénérescence cérébrale qui crée le phénomène de transparence. N’étant pas directement un membre du Bureau, il a toutefois l’aval du gouvernement pour étudier les transparents dans les meilleures conditions. Seulement voilà : Yamada déteste les transparents ! A lui seul, il symbolise les craintes d’une partie du monde face à ces phénomènes qui représentent une possible évolution du genre humain, avec à terme, sa disparition face à ces êtres supérieurs. Ainsi, au début de l’histoire, Yamada n’a qu’une seule idée en tête : éradiquer tous les transparents ! Pourtant, il ne veut pas devenir un tueur en série psychopathe, et de par sa grande intelligence, cherchera toujours le meilleur moyen pour commettre son crime sans éveiller les soupçons. Même s’il n’arrive heureusement jamais à ses fins, il continue toutefois à évoluer à la proximité de ces êtres…
Plus tard dans le récit, une alternative viendra perturber sa résolution, car il découvrira le moyen d’annihiler le phénomène via une intervention chirurgicale. Mais bien malgré lui, il finira par être également fasciné par ces êtres, notamment le jeune Ken’Ichi Satomi, chirurgien également, qui semble parti pour devenir son successeur. Yamada inspire donc la méfiance et le doute des Hommes face à ces nouveaux individus, et la part d’ombre qu’il apporte amène de la crédibilité au récit. De par sa position privilégiée et sa grande intelligente, il reste un personnage inquiétant tout au long du récit.
