Collégien passionné d'astronomie, Taro est contraint d'abandonner ses études quand son grand-père meurt et le laisse seul. Très vite, on découvre alors un jeune garçon loin de se laisser abattre. Mais pour lui, tout ne fait que commencer lorsqu'il fait la rencontre de Sora, jeune fille devenue minuscule après être tombée du Nanja Monja, le grand et mystérieux arbre régnant sur le village. Cet événement est le point de départ des aventures de Taro, qui découvrira petit à petit le passé de son grand-père, son lien avec Sora, et ses propres origines.
