Le jeu se déroule durant la même période que le premier opus de la série, mais avec une trame inédite centrée sur l'Escadron E de la Fédération. Le commandant Claude Wallace et ses amis d'enfance s'engagent dans un conflit impitoyable. Pourront-ils remporter la victoire face aux terribles blizzards, aux hordes de soldats impériaux et aux pouvoirs quasi divins des Valkyria ?
Notons que le système de combat BLiTZ et le moteur graphique CANVAS sont de retour.